2019年6月之前，校外事办与国际教育学院合署办公。2019 年6月，校外事办（港澳台事务办公室）更名为国际合作交流处（港澳台事务办公室），2025年1月，国际教育学院与国际合作交流处（港澳台事务办公室）合并，内设学院办公室、教学科研办公室、留学生招生办公室、留学生管理办公室、对外汉语教学部、出入境管理办公室、交流与项目管理办公室等7个机构。

国际学院成立于2008年，当年即向教育部申报招收全英文授课临床医学专业来华留学生。2009年开始首次招收自费来华汉语授课的口腔和临床医学专业来华留学生。2010年起成建制招收全英文授课临床医学专业来华留学生。2013年起，获批承担招收中国政府奖学金来华留学生，同年开始招收来华留学硕博士生。2017年起，招收中国-东盟丝绸之路奖学金生。截止2025年1月底，我校在籍来华留学生共计334人(全英文授课临床医学专业本科生300人，硕士研究生26人，博士研究生8人),来自28个国家和地区，为安徽省学历教育来华留学生最多的高校之一。目前，我校已培养了555名来华留学毕业生(本科生489人，硕士生51人，博士生15人)，毕业学生除部分继续攻读更高学位外，大部分已成为各国医疗行业的新兴力量，成为了中国与世界各国友好交往的桥梁，促进了学校国际化水平提升和多元化氛围营造，拓宽了学校对接国家对外开放战略和“一带一路”倡议渠道。学院2013年通过教育部来华留学生医学本科教育（英语授课）检查。2014年被评为“全国来华留学先进单位”及“安徽省教育系统先进集体”。2015年成为安徽省外国留学生教育管理学会秘书长单位。2017年通过全国来华留学质量认证。2019 年通过教育部来华留学生医学教育专项调研，同年获批医学汉语水平考试考点资格首批院校。2020年获批全国汉语水平考试考点院校。2021年获全省教育外事工作先进单位。2023年通过全国来华留学生质量认证再认证。2024年通过来华留学生临床医学专业（英语授课）项目质量认证。

学校2021 年获“全省教育外事工作先进单位”，2023 年获批“安徽省国际交流合作基地”。已与20个国家和地区的44 余所大学和研究机构建立了合作关系，其中近5年新增4 国家地区12所高校，与美国、俄罗斯、德国、澳大利亚、日本、马来西亚、巴基斯坦、墨西哥、南非、肯尼亚、加纳等国家的高校签署合作协议或合作备忘录25份。与美国阿肯色州立大学合作举办的“健康服务与管理”专业中外合作办学项目于2021年获教育部批准，是安徽省医科院校第一个且是目前唯一的中外合作办学项目。办学层次为本科，培养模式为“3+1”，三分之一课程为外教和引进课程。已顺利招生3年，项目运行良好。协助选派近300 余名教师和医生出国（境）访学研修、参加国际学术会议、学术交流合作，并做好出国（境）管理及境外管理工作。每年办理因公出国（境）100 余人次。其中2024 年，办理因公出国（境）及赴港澳台66 个团组，共110 人次，其中校际交流访问5人次，访学研修40人次（含卓越博士计划10人），国际学术会议及科研合作65人次。新办因公证件100本，邀请外国人来华工作1人次，开展行前教育40次，设立“出国（境）事务咨询服务室”，为教职工提供咨询答疑等服务。组织台湾籍学生参加港澳台学生国情教育培训，参加教务处对台湾籍学生的招生工作。我校在读台湾本科生7名，在全省高校中数量最多。